La nouvelle 1ere page du topic Folding

[bennyb]

Le projet Folding@Home

Folding@Home est un projet scientifique mis en place par un laboratoire de l'université de Stanford, aux Etats-Unis. Ce projet vise à mieux comprendre comment les protéines se replient dans leur environnement et quels sont les disfonctionnements associés à différentes maladies (maladie d'Alzheimer, maladie de Parkinson, maladie de Huntington ou Cancers).

Ce projet, salué par la communauté scientifique internationale, a déjà permis de générer des résultats publiés dans de prestigieuses revues scientifiques (Articles publiés).

Il est très important de souligner que les données générées sont totalement libres de droits et d'accès, garantissant la disponibilité des résultats à l'ensemble de la communauté scientifique et empêchant leur récupération par des entreprises privées.

Plus de 500 000 ordinateurs participent déjà au projet à travers le monde.

C'est pourquoi les membres de la communauté PC INpact se devaient de soutenir cette démarche !

Comment participer à Folding@Home ?

La simulation du repliement des protéines nécessitant une puissance de calcul considérable, les chercheurs ont donc mis en place un système de calcul partagé, permettant à chacun d'utiliser les ressources non utilisées de son ordinateur pour contribuer à l'étude.

Concrètement, c'est simple ! Rejoignez la miniTeam du site PC INpact, au sein de l'Alliance Francophone !

Seules quelques étapes sont nécessaires pour participer :

1 - Télécharger, sur cette page, la dernière version du programme adaptée à votre OS ( la version "console" est conseillée, car plus rapide et plus stable que les versions graphiques)

2 - Créer un répertoire dans lequel le programme sera installé, puis y coller le fichier téléchargé

3 - Double-cliquer sur le fichier pour lancer le programme et sa configuration.

• En UserName mettre le préfixe [inpact] suivi de votre nom. Ex : [inpact]_votrepseudo
  
  
• En Team Number mettre le numéro 51 (Numéro de l'alliance francophone)
  
  
• Répondre "n" aux autres questions, ou se reporter plus bas pour des explications détaillées des différentes options (Voir la section Configuration Avancée)
  
  

Ca y est, vous participer déjà au projet !

Il ne vous reste plus qu'a venir nous dire bonjour, en postant dans ce topic. :yaisse:

Il est à noter que vous n'êtes autorisé à faire tourner Folding@Home que sur des machines qui vous appartiennent ou sur lesquelles vous avez l'autorisation de l'administrateur du parc informatique pour faire tourner le logiciel. Tout autre utilisation de Folding@Home serait contraire à la licence d'agrément de Folding@home (et ne serait tout simplement pas une bonne idée en général).

Votre contribution et celle de la miniTeam PCINpact au projet Folding@Home

Folding@Home remercie les participants en leur attribuant des points (suivant certains critères) après chaque calcul (appelé Work Unit ou WU) terminé et renvoyé à Stanford.

Ceci donne lieu à une compétition amicale entre les différents plieurs de la miniTeam et entre les différentes équipes.

Cet aspect ludique n'est évidement pas le but premier de Folding@Home, mais permet une certaine émulation entre les participants, bénéfique pour la recherche.

Afin de suivre votre contribution et de celle de la miniTeam, différentes méthodes sont à votre disposition.

Suivre votre travail en local :

• Electron Microscope III
  

Vous pouvez télécharger la dernière version de EMIII

La miniteam dispose de deux skins pour EMIII personalisées aux couleurs de PCINpact.

Cliquez sur une des images ci dessous pour télécharger la skin. Un pack comprenant EMIII (v3.2.0) et les deux skins PCINpact est également disponible ici.

• FahMon
  

Programme plus simple, mais tout aussi efficace.

• Samurize
  

Vous utilisez Samurize pour afficher des informations sur votre bureau ? La miniTeam dispose d'un script permettant l'affichage des principales informations concernant votre participation à Folding@Home. Script téléchargeable ici.

Informations disponibles via le script samurize

Suivre l'évolution des scores des plieurs et des équipes :

Classement interne des minis teams au sein de l'alliance francophone

Classement interne de la miniTeam PC INpact

(update tous les jours vers 22H30/23H)

Statistiques sur extremoverclocking.com

(update toutes les 3 heures et serveur ultra rapide avec statistiques détaillées)

Configuration Avancée

Configurer Folding après le premier démarrage

Pour configurer l'application Folding après le premier démarrage, il suffit de créer un raccourci vers l'application, d'ajouter " -configonly" après le lien dans les propriétés du raccourci et de lancer le programme via ce lien modifié.

Mode Service

Afin de rendre totalement transparente l'application F@H sous Windows XP/2000, il est possible de la faire tourner en tant que Service.

Pour cela, lors du premier démarrage ou à l'aide de la méthode décrite au dessus, répondre "y" à la question "Launch automatically at machine startup, installing this as a service (yes/no) ?"

Après redémarrage de l'ordinateur, le programme se lancera automatiquement et de façon totalement transparente. Vous pouvez vérifier dans le gestionnaire de tâche de Windows qu'un programme de type "FahCore" utilise les ressources de votre machine lorsque vous ne l'utilisez pas.

Réglages Optimaux

Ils existent également des réglages avancés pour les plieurs désirant optimiser leur machine afin de contribuer au maximum à Folding@Home.

• Réduire ces temps de calculs
  

Il semble que certaines instructions dans nos processeurs permettent d'accélérer les calculs de 20 à 30 %.

- Pour en profiter, si vous utilisez un raccourci pour lancer le programme, ajouter " -forceasm" à la suite du lien dans les propriétés du raccourci.

- Si vous avez installé le client Console en service , effectuer les modifications suivantes :

Dans la base de registre (>Démarrer>Exécuter>Regedit)

Recherchez la clef

HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\ControlSet00X\Services\FAH@E:+FoldingHome+FAH502-Console.exe

Editez Imagepath et rajoutez -forceasm

Vous obtenez ceci : -svcstart -forceasm

Arrêtez et redémarrez le service via la commande

Démarrer > Exécuter > services.msc (recherche du service FAH@E:+FoldingHome+FAH502-Console.exe)

- Dans les deux cas, dans le fichier FAHLOG.TXT, vous devriez voir quelque chose comme ceci :

Launch directory: D:\Program Files\Folding\Folding@Home
Executable: D:\Program Files\Folding\Folding@Home\FAH502-Console.exe
Arguments: -forceasm

 Warning:
 By using the -forceasm flag, you are overriding
 safeguards in the program. If you did not intend to
 do this, please restart the program without -forceasm.
 If work units are not completing fully (and particularly
 if your machine is overclocked), then please discontinue
 use of the flag.

• Accepter les Work Unit nécessitant une quantité de mémoire importante
  

Il est possible de configurer le client Folding@Home pour qu'il accepte certains types de WU qui nécessitent une quantité importante de RAM. Ces calculs rapportent proportionnellement plus de points que les plus petits.

Pour cela, dans la configuration du client, répondre "y" à la question "Allow receipt of work assignments and return of work greater than 5MB in size (such work unit have large memory demands)".

• Utilisation de toute la puissance de calcul des machines multiprocesseur ou basées sur des processeurs dual-core
  

Avec de telles configurations, pour utiliser 100% des ressources de votre machine, il est nécessaire de faire tourner plusieurs clients Folding@Home en même temps.

Pour cela, il suffit d'installer 2 clients folding dans 2 répertoires différents (par exemple C:\Program Files\Folding@Home1\ et C:\Program Files\Folding@Home2\ ).

Il faut ensuite mettre deux IDMachines différentes dans la configuration avancée des deux clients, puis configurer chacun des deux clients pour les mettre en service et pour forcer les optimisations.

Autres informations

- Vous êtes jaloux de tous les membres qui ont une belle image dans leur signature sur le forum !? Vous aussi voulez une signature comme celle-là :

Rien de plus simple ! Il suffit de se rendre sur cette page, dédiée aux signatures sur le forum de l'Alliance francophone, et demander le modèle 16. Athropos se chargera de vous créer votre signature .

Il est à noter qu'il faut que vous ayez renvoyé au moins un calcul terminé à Stanford pour pouvoir obtenir une signature.

- Vous en voulez encore plus ... Captain Hadock vous a concocté une petite version de la bannière que vous pouvez également incorporer dans votre signature.

Inclure ces images dans votre signature permet de faire connaître le projet parmi les membres du forum .

FAQ et Préjugés

Mon PC sera ralenti ...

Non, puisque l'application qui tourne en arrière-plan n'utilise que les ressources CPU NON UTLISEES.

Une preuve ? Jetez un coup d'œil sur cet article présentant de nombreux benchmarks.

Mon PC va être espionné via cette application ...

Non, ce programme est parfaitement sécurisé, l'application ne fait que :

1 - Se connecter sur les serveurs de Stanford pour obtenir du travail.

2 - Plier pendant plusieurs heures, voir plusieurs jours.

3 - Renvoyer le résultat aux serveurs.

Je ne peux pas / n'ai pas envie de laisser mon PC allumé 24H/24, donc ca sert à rien ...

Non, ne vous inquiétez pas, le calcul s'arrête en éteignant le PC et reprendra là où il a été stoppé.

Et vous savez ce qu'on dit des petits ruisseaux qui deviennent fleuves ...

Laisser tourner ma machine en permanence va entraîner une facture EDF salée et n'est pas très écologique ...

Ces problèmes ont été évoqués sur le site de l'Alliance Francophone. Jetez donc un coup d'œil aux liens ci-dessous :

Lien traitant du coût lié à la consommation électrique

Concernant la consommation, il est évident que, votre ordinateur fonctionnant déjà une partie de la journée lorsque vous l'utilisez normalement, le surcoût engendré par F@H est inférieur à l'estimation donnée.

Participation écologique au projet Folding@Home

[FRANCK]

appartiennentou. oups

émulation entre les participant bénéfique. virgule apres participant(s), et le s

J'aime pas la police des chapitres.

demande à terminou les captures pour les ((...))

Prevooir les liens hyper.

ps : je vais voir si j'ai une copi des capture ? mais de memoire c'est du .doc, et il avait galeré.

ps2 : sinon bon debut.

[tibtib17]

J'aime pas la police des chapitres.

Au contraire, moi, j'aime bien. question de gout sûrement...

Sinon, je suis content de la refonte de la page principale. Bravo!

Edit: Je mettrais en gras la phrase "permettant à chacun d'utiliser les ressources non utilisées de son ordinateur pour contribuer à l'étude", surtout le "ressources non utilisées"

Edit 2 : vers la fin " Laissé tourné " --> "Laisser tourner"

[bennyb]

merci pour lez comments

pour l'orthographe/grammaire, un petit passage par word a la fin corrigera tout ca apres avoir ecrit une these, le correcteur orthographique de word est mon ami

pour l'instant a mon avis faut plus s'attacher à la structure et à repertorier les infos à mettre

pour les captures, ca serait effectivement plus simple de pourvoir les recuperer, sinon je le referais ca prend pas deux heures non plus

[FRANCK]

j'ai retrouver une capture de config, j'arrive pas a t'envoyer de mail

pour l'histoire edf, y avait un petit calcule sur le site de l'alliance si je me rappel bien

[bennyb]

j'ai retrouver une capture de config, j'arrive pas a t'envoyer de mail

bennyb3d_AT_free_point_fr

[INpact_Karbon]

Si vous voulez , je pourrais faire un tuto pour l'installation de F@H (console) en service sur Windows XP.

(Sous quelques jours en fait. )

[FRANCK]

tiens une idee bete,

pourquoi pas un compteur de la team (nombre de membre, total de points, points du jour, etc) en temps "reel", style la signature.

edit : http://www.alliancefrancophone.org/faq.php...q_id=29&config=

http://www.alliancefrancophone.org/faq.php...q_id=59&config=

le 2eme pour edf

[bennyb]

tiens une idee bete,

pourquoi pas un compteur de la team (nombre de membre, total de points, points du jour, etc) en temps "reel", style la signature.

pas bete du tout

en +, KoinKoin peut peut etre nous arrange ca puisqu'il a son propre système pour sa signature

[FRANCK]

niveau design, peu tu faire en sorte que visuelement on sache quand c'est un lien (par rapport au texte).

peut etre couleur ou police specifique ?

[bennyb]

merci pour les liens

ouep, justement je suis entrain de rajouter les prmiers liens. par defaut les liens sont gris fonce Vs noir pour le texte c'est vrai que c'est pas tres pratique

le plus simple c'est peut etre de pas utiliser le soulignement dans le texte comme ca tout ce qui sera souligne est du lien

[FRANCK]

de plus l'ajout d'image pour illustrer, car ca fait un peu trop studieu voir rebarbatif.

madel de skin pci

logo emiii

logo de l'aliance

etc

de la joie pour plier avec le sourire

[bennyb]

de plus l'ajout d'image pour illustrer, car ca fait un peu trop studieu voir rebarbatif.

madel de skin pci

logo emiii

logo de l'aliance

etc

de la joie pour plier avec le sourire

+1000

j'arrive, j'arrive

je reprendrais ce soir

en tous cas merci a toi

[aeolys]

Super boulot Bennyb !

Sinon j'ai remarqué que les liens vers les miniteams et le lien vers la team PCi étaient inversés.

[theocrite]

Bennyb : Tu veux maintenir le topic maintenant ?

[aeolys]

de plus l'ajout d'image pour illustrer, car ca fait un peu trop studieu voir rebarbatif.

madel de skin pci

logo emiii

logo de l'aliance

etc

de la joie pour plier avec le sourire

+1 également.

Si il y a besoin d'un coup de main pour quoi que ce soit...faut pas hésiter !

[FRANCK]

Bennyb : Tu veux maintenir le topic maintenant ?

ca semble plutot une bonne idée

[aeolys]

bah oui ...tant qu'on n'a pas fini de refaire cette première page...

[bennyb]

Bennyb : Tu veux maintenir le topic maintenant ?

ca pourrait etre l'idee a terme, puisque Terminou n'est plus dispo et que les plieurs on pas mal d'idees a mettre en place pour remotiver les troupes et donc besoin de quelqu'un qui a du temps a consacrer

pour l'instant on essaye de refaire collectivement une page de présentation plus sympa que l'actuelle qui a pas mal vieillie

[aeolys]

Je me suis permi d'écrire un petit texte sur l'aspect scientifique de la chose :

"Le projet Folding@Home (prononcé Folding at Home) est un projet entièrement développé par l'université de Stanford aux États-unis.

Folding@Home est un projet de distribution de données à plusieurs ordinateurs.

En gros, le projet permet d'utiliser la puissance inutilisée de nos ordinateurs pour calculer ce qu'on appelle en anglais le "pliage de protéines" (To fold en anglais veut dire plier, en français on parle de repliement de la protéine ou encore de structure tertiaire voire quaternaire quand il y a association de chaînes protéiques).

Mais qu'est-ce qu'une protéine ?

Une protéine est une molécule de plus ou moins grande taille (formée d'acides aminés) qui a un rôle plus ou moins important dans le fonctionnement du corps humain.

Connaître la formule chimique d'une protéine est relativement simple. Cependant une protéine est une 'construction' dans l'espace à 3 dimensions (sans compter son comportement dans le temps ce qui rajoute une 4e dimension). Sous différentes influences chimiques la molécule prend une forme géométrique très particulière. Cette forme géométrique est extrêmement complexe à calculer . C'est un peu comme utiliser des legos qui sont individuellement très simples mais qui permettent de faire des constructions parfois forts complexes.

L'idée géniale de l'université de Stanford est d'utiliser la puissance inutilisées des ordinateurs de personne volontaire pour participer au projet. Actuellement plus de 500 000 ordinateurs à travers le monde participe au projet !"

Voilà c'était ma petite contribution, Bennyb utilise là comme tu veux (ou pas tu es libre !)

[FRANCK]

c'est plus qu'une idee je dirais

c'est une necessité

y a plus de chef au manette

et bennyb est present.

alors tous avec bennyb

ps: sauf si tu fait comme rom

[aeolys]

Tant que j'y suis comment-on pour forcer le calcul sur une grosse protéine exactement ?

[FRANCK]

sur le post d'origine tu a la reponse,

mais je vais etre gentil, dans le config tu dit oui pour les options et ca te pose la question du style plus de 5mb et tu met yes.

[aeolys]

Je dois avouer que j'avais la flemme de chercher...

Un grand merci !

[bennyb]

alors tous avec bennyb

@aeolys : je me suis effectivement moi aussi demander s'il fallait developper un peu l'aspect scientifique.

a voir en fonction de l'avis de tout le monde

sinon liens inversés corrigés