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toTOW

INpactien
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Posts posted by toTOW

  1. On 02/04/2020 at 17:10, Minikea a écrit :

    hello, je rejoins le mouvement. j'ai refait mon pseudo en [Inpact]_Minikea, mais je dois avoir un vieux pseudo sur f@h, il faudra que je vois si on peut fusionner des comptes...

    On ne peut pas fusionner ... par contre si tu retrouves ton ancien pseudo dans la liste, tu peux l'utiliser à nouveau.

    Pour remettre à zéro le délai entre les demandes de WU, Pause/Resume sur le slot.

     

    Sinon, la news scientifique du jour : https://foldingathome.org/2020/04/03/capturing-the-covid-19-demogorgon-aka-spike-in-action/ 🙂

    • Aime 1
  2. Et oui, j'avais un serveur dédié non utilisé qui trainait alors je l'ai converti en Work Server pendant la crise, pour héberger les projets internes à tester qu'on ne pouvait même pas récupérer avec la surcharge des serveurs ...

    Le problème, c'est que je n'ai que 3 To de stockage dessus et que ça part très vite ... la demande pour les sponsors intéressés, pour un serveur de production c'est 50 à 100 To de stockage, une connexion Gigabit illimitée, et un CPU pas trop mou ... et une machine comme ça, ça coûte très cher à financer si ce n'est pas sponsorisé (coucou Microsoft et Oracle qui nous en fournissent).

    J'ai du budget pour démarrer un deuxième serveur, mais pas avec assez de stockage ... du coup tant pis ...

  3. Petit résumé de la situation avec la dernière communication officielle (qui date d'hier) :

    • Nous sommes au courant de la pénurie de WUs.
    • Ceci arrive car il y a une augmentation d'environ x20 de la demande de WUs.
    • Nous travaillons dessus et nous espérons avoir une solution très bientôt.
    • Laissez vos machine tourner, elle finiront par plier seules.
    • A chaque fois que nous doublons notre capacité, le nombre de volontaires souhaitant participer augmente d'un facteur 4, dépassant tout ce que nous faisons.
  4. @Muzikals Effectivement, c'est un GPU de la génération Tesla (GeForce 2xx et 3xx), c'est trop vieux pour plier. Les GPU les plus anciens supportés sont les Fermi (GeForce 4xx). Tu peux donc supprimer ton slot GPU et libérer le slot CPU pour utiliser tous les threads.

    @Zetek FAH ne permet pas de brider l'utilisation GPU tout simplement car contrairement à un CPU, il n'y a pas d'ordonnanceur. La gestion des priorités sur GPU est aussi très limitée à cause de ce point. Beaucoup d'utilisateur de FAH qui veulent limiter les performance ou la bruit jouent avec les paramètres du GPU avec MSI Afterburner (par exemple) : le plus simple, c'est de diminuer le Power Limit et/ou la limite de température du GPU.

    Sinon plus généralement, est-ce que vous avez remarqué une amélioration dans la disponibilité des WUs ? Plusieurs serveurs et projets sont entrés en production hier et je vois que le taux d'assignation global est passé de 50 000 à 86 000 WUs par heure ...

  5. Il y a 10 heures, Muzikals a écrit :

    Allez hop, je m'y suis mis aussi il y a quelques jours sur deux machines sous windows !
    On voit clairement qu'ils sont surchargés mais au moins, c'est prêt !
    Une des machines a un GPU qui pourrait servir mais il semble qu'il n'a rien à se mettre sous la dent ... ou c'est le fait que le "Work Server" soit 192.0.2.1 o_Ô

    Etre envoyé vers ce Work Server indique que le GPU n'est pas supporté ... quel est-il (que je vérifie si c'est pas une erreur) ?

    Pour rappel : pour pouvoir être utilisée sur FAH, les GPU doivent être du AMD ou du nVidia, et ils doivent supporter les calculs en double précision.

    Bon, des serveurs sont en train d'entrer en production (déjà 3 hébergés par Microsoft), de nouveaux projets sont aussi mis en ligne ... mais tout part vite, l'ensemble du réseau est fortement sollicité. Il y a également une limite du taux d’assignation des WUs pour éviter de tout planter ou d'avoir trop de problèmes de renvoi de résultats.

    Si vous voyez ce genre de message dans le client, ne vous inquiétez pas, c'est cette limite qui est active :

    Citer

    11:04:40:WU00:FS00:Connecting to 65.254.110.245:8080
    11:04:40:WARNING:WU00:FS00:Failed to get assignment from '65.254.110.245:8080': No WUs available for this configuration
    11:04:40:WU00:FS00:Connecting to 18.218.241.186:80
    11:04:41:WARNING:WU00:FS00:Failed to get assignment from '18.218.241.186:80': No WUs available for this configuration
    11:04:41:ERROR:WU00:FS00:Exception: Could not get an assignment

     

  6. On 16/03/2020 at 01:56, eromog a écrit :

    Salut à tous,

    j'avais relancé fah depuis quelques jours, ça tombe bien.

    Par contre, je constate ( sous windows ) que fah ne sollicite que 45 % du gpu ( pour une nvidia GTX 970 ) ou 25 % ( pour une nvidia RTX 2070 ).

    Quelqu'un aurait une idée du pourquoi du comment ?

    Si tu regardes avec le gestionnaire de taches Windows, il ne faut pas regarder la charge "3D" mais la charge "Compute" ... et pour être tranquille, il vaut mieux regarder avec GPUZ !

     

    Et on enfin une page dédiée : https://www.alliancefrancophone.org/faq/covid19

  7. @Mihashi Merci beaucoup pour le tuto ! La seule étape inutile à mon avis est l'installation de CUDA qui n'est pas utilisé sous FAH (pour l'instant tout du moins).

     

    Un GPU n'a pas de scheduler comme un CPU, on ne peut donc pas régler la priorité de tâches.

    Je n'aime d'ailleurs pas le "slider" Light/Medium/Full car je ne sais jamais ce qu'il fait exactement. Je préfère le laisser sur Full et faire mes réglages dans le fichier de config ou avec FAHControl.

    Après plus le GPU est bas de gamme, plus le lag de l'interface se fait ressentir. Et pour pas te mentir, une Quadro 2000, c'est ancien, et très peu puissant : un vieux GF106 d'une GeForce GTS 450. A ta place, je m'embêterais pas avec le GPU sur cette machine et je mettrais tout en CPU !

    Pour ta deuxième machine, c'est de suite plus intéressant (j'ai toujours ma fidèle 980 au pliage). A mon avis, comme tu as installé client alors que la carte n'était pas détectée, il a réglé le paramètre <gpu v='false'/> dans le fichier config.xml (sous Linux : /etc/fahclient/config.xml)... il faut donc l'enlever et redémarrer le client.

     

     

  8. Il y a 1 heure, Alderic a écrit :

    Salut les gars !

    Je viens de join, mais par contre je n'ai pas le coronavirus dans les projet 😕

    Juste  Any disease /Alzheimer/cancer/huntington/parkinson

    Pour avoir du COVID-19, il faut choisir "Any disease".

     

    Des projets CPU (Core A7) arrivent avec les numéros de dossard 14328/14329/14530/14531 ! Il n'y a plus aucune excuse pour ne pas participer ! 😄

    Fun fact : ce soir, l'ensemble du projet assigne 16 500 WUs par heure ... la semaine dernière, nous étions à seulement 3-4 000 ...

    D'ailleurs, les serveurs GPUs en chient à suivre le rythme ...

  9. Ca y'est, les projets sont distribués à tous !

    Petit rappel pour être sûr d'en avoir : c'est du GPU et vous devez choisir la Cause "Any".

    Le serveur qui distribue ces projets en chie face à la demande ...

    Pour les linuxiens, un workaround pour faire marcher FAHControl (seul FAHClient est indispensable) : installer Python2 manuellement et faire cette bidouille https://foldingforum.org/viewtopic.php?p=310609#p310609

    Sinon, on peut toujours régler le client avec le fichier de config et Webcontrol ... ou contrôler le client avec une machine distante.

  10. C'est parti, les projets arrivent en bêta. Si tout va bien, ils seront distribués à tous dès demain !
     
    Citer

     

    Merci à tous pour votre patience pendant que nous avons passé une semaine à décider comment utiliser au mieux la puissance supplémentaire exceptionnelle que nous avons obtenue de vous tous qui souhaitez aider dans la lutte contre le coronavirus. Nous nous somme concentrés sur 6 projets actuellement et il y a beaucoup de nouvelles données biochimiques à venir avec lesquelles nous allons probablement préparer de nouveaux projets.

     

    Voici de courtes descriptions des projet. Merci de nous laisser quelques jours de plus afin de vous concocter un post complet sur le blog décrivant ce que nous espérons atteindre avec ces projets. En général, nous recherchons des conformations alternatives et des poches cachées dans les cibles de médicaments les plus prometteurs, ce qui ne peut se voir qu’en simulation et non dans les modèles statiques (note aux spécialistes, le texte original : static crystal / cryo-EM structures). Il y des données très récentes issues des dépistages maintenant disponible pour certaines d’entre elles (note : les cibles de médicaments) que nous utiliserons pour valider les simulations et aider au dépistage direct. La collecte d’un maximum de données aussi rapidement que possible sera crucial, merci encore à vous tous de rendre ceci possible !

     


    Tous les projets utilisent le nouveau core GPU OpenMM 22.

    • 11741: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec le récepteur humain ACE2. atomes: 165550, crédit: 15396
    • 11742: protéase du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec un inhibiteur. atomes: 62227, crédit: 9405
    • 11743: protéase du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) - cible médicamenteuse potentielle. atomes: 62180, crédit: 9405
    • 11744: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV (virus provoquant le SRAS) piégé par un anticorps SARS-CoV S230. atomes: 109578, crédit: 7608
    • 11745: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV (virus provoquant le SRAS) muté en SARS-CoV-2 (virus provoquant COVID-19) piégé par un anticorps SARS-CoV S230. atomes: 110370, crédit: 7685
    • 11746: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec le récepteur humain ACE2 (structure alternative à 11741). atomes: 182699, crédit: 16615
    Si vous voyez des erreurs de traduction ou que vous avez de meilleures formulations à proposer, n'hésitez pas ! 🙂
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