Team Folding@home: la Team INpact qui guérit la planète

[jeanjean15]

Salut .

Un petit bonjour pour dire à Totow qu'il a le bonjour de Grandpa_01 du forum Hardforum .

Voir le lien ci-joint :

=> http://hardforum.com/showpost.php?p=1040368699&postcount=20

Modifié le 24 novembre 2013 par jeanjean15

[keneda212]

j'ai passé les 5 millions

[Ellierys]

Les 3 millions ici

[jeanjean15]

On a passé les australiens au classement des équipes .

Un travail de longue haleine .

[keneda212]

mais on se fait rattraper par les chinois

[Oliewan]

http://www.lesnumeriques.com/telephone-portable/sony-aidez-recherche-medicale-avec-votre-smartphone-n38721.html

 

Au cas ou vous n'auriez pas su

[keneda212]

y'en a qui vont chialer quand ils vont voir leur batterie se vider très vite ^^'

sinon je vais pas tarder de feter les 10 millions

[keneda212]

10 millions

[Zarck]

Un message tous les deux ans, c'est la nuit des morts vivants ce topic, viendez ici ->

 

http://forum.boinc-af.org

 

[Beuzz]

Bonjour,

 

Nouveau sur le forum, et plus ou moins ancien sur F@H, en voyant une equipe Next Inpact j'ai pas pu m'empecher de venir grossir le rang.

 

Voici la conf de la machine qui tourne H24:

2x Xeon E5530

GTX780 TI

 

Configuration créer y as un petit moment pour faire du montage vidéo, convertie aujourd'hui en serveur fichier, sql, et autre joyeuseté.

 

Beuzz.

[juetges]

Bonjour les Inpactiens,

Une petite visite pour vous rappeler le projet Folding@home, mené par l'université Stanford en Californie.

C'est un projet scientifique de calcul distribué à caractère biomédical, qui utilise les ressources disponibles d'ordinateurs personnels, sur la base du bénévolat, au profit de la recherche scientifique. Son but est l'étude du processus de repliement des protéines, dont les anomalies sont les causes essentielles de fléaux comme le cancer, la maladie d'Alzheimer, celles de Creutzfeldt-Jakob ou de Parkinson, et bien d'autres.

Certains parmi vous ont déjà contribué à faire avancer la science au sein de ce projet, et quelques-uns continuent à s'investir au quotidien !
Votre site a même créé il y a quelques années une mini-team au sein de l'Alliance Francophone : [Inpact]
Or actuellement l'Alliance est en danger :
- le site qui l'héberge et qui nous permettait de nous fédérer est menacé de disparition,
- les participants sont de moins en moins nombreux.

Nous, les Zébuloniens, essayons de raviver la flamme foldingue, et c'est pour cela que je vous contacte.

Nous avons actualisé les tutos sur notre site (si vous le souhaitez, vous pouvez piocher allègrement dedans) afin de faciliter l'installation du logiciel, et avons repris les statistiques de JPG Soldat pour relancer la mini-guerre entre sites : se tirer la bourre est toujours motivant !

C'est un travail de longue haleine (toute aide est bienvenue), il serait vraiment dommage de laisser tomber tout cet investissement...
Nous espérons vous revoir vite dans la compétition.

 

Ju&Ges, de l'équipe [Zebulon.fr] de Folding@home (team 51 : Alliance Francophone)

 

PS aux modérateurs : Désolé pour le déterrage du sujet... Et si vous jugez ce message trop prosélyte, nous vous faisons confiance pour le conformer aux usages de votre forum.

 

Modifié le 11 octobre 2017 par Soltek
Mis couleur auto de la police qui piquait les yeux sur thème sombre

[DK de Zeb]

Bonjour les INpactiens !

Nouvelle visite d'un membre de la zebteam pour saluer vos membres actifs et vous signaler quelques liens :

• Kana-chan, l'un des membres de notre équipe a ressuscité les stats de JGP Soldat pour l'Alliance Francophone il y a quelques mois.
Elles sont à nouveau accessibles ici : folding.fr/stat
- la page de vos actifs : kanastats → INpact.htm
- la liste complète de vos plieurs : kanasats → INpact.txt
Davantage d'infos ici : forum.zebulon.fr → Folding@home : les stats

• L'ancien forum de l'Alliance Francophone a fermé, un nouveau a été ouvert en janvier ici : alliancefrancophone.000webhostapp.com/forum/index.php
(visitez aussi le nouveau site : alliancefrancophone.000webhostapp.com)

 

  DK, de l'équipe [Zebulon.fr] de Folding@home (team 51 : Alliance Francophone)

[MeowMeow]

On 11/10/2017 at 14:14, juetges a écrit :

Bonjour les Inpactiens,

Une petite visite pour vous rappeler le projet Folding@home, mené par l'université Stanford en Californie.

C'est un projet scientifique de calcul distribué à caractère biomédical, qui utilise les ressources disponibles d'ordinateurs personnels [...]

Cela me rappel deux jeunes arrêtés pour piratage par la gendarmerie. Ils avaient expliqués, avoir donnés accès aux ressources de leurs ordinateurs pour la bonne cause...

Modifié le 16 mars 2018 par trOmAtism

[DK de Zeb]

Il y a 4 heures, trOmAtism a écrit :

Cela me rappel deux jeunes arrêtés pour piratage par la gendarmerie. Ils avaient expliqués, avoir donnés accès aux ressources de leurs ordinateurs pour la bonne cause...

Serait-ce pour cela que, sur les 3250 plieurs inscrits dans la mini-team INpact, seuls 9 restent actifs ?

[L33thium]

je crois que ordinateur actif ou pas, ça changeait pas grand chose sur la consommation électrique, avant.

de nos jours c'est différent, ainsi que l'overclocking qui n'est plus très à la mode (le pliage était un très bon test de stabilité)

Et aujourd'hui ceux qui ont des ressources à revendre le font plutôt pour miner.

[DK de Zeb]

Bonjour les INpactiens,

Nouvelle petite visite dans le but de vous féliciter pour votre premier milliard !

(c) kanastats 23/08/2018

Et bravo aussi aux actifs des dernières semaines non mentionnés sur cette capture :
[Inpact]_stology         6 813 888    avril
[inpact]_malinkias     5 597 664    avril
[Inpact]_Krocel           3 485 996    mai
[inpact]_El_Nino         1 230 297    juin
[Inpact]_JexSM             636 656    mai
sthire01                            75 234    avril

Et non, on ne mentionnera pas que Québec vient cette semaine aussi de vous déloger de votre 3ème place au classement des mini-teams de l'Alliance ! 

 

Petit rappel :

On 15/03/2018 at 18:55, DK de Zeb a écrit :

• Kana-chan, l'un des membres de notre équipe a ressuscité les stats de JGP Soldat pour l'Alliance Francophone il y a quelques mois.
Elles sont à nouveau accessibles ici : folding.fr/stat
- la page de vos actifs : kanastats → INpact.htm
- la liste complète de vos plieurs : kanasats → INpact.txt

Davantage d'infos ici : forum.zebulon.fr → Folding@home : les stats

• L'ancien forum de l'Alliance Francophone a fermé, un nouveau a été ouvert en janvier ici : alliancefrancophone.000webhostapp.com/forum/index.php
(visitez aussi le nouveau site : alliancefrancophone.000webhostapp.com)

Y'a plus de bavards chez INpact ?

 

  DK, de l'équipe [Zebulon.fr] de Folding@home (team 51 : Alliance Francophone)

Modifié le 23 août 2018 par DK de Zeb

[toTOW]

En cette période de crise du Coronavirus, il est temps de relancer cette belle mini-team [Inpact] ... Pourquoi ? Tout simplement car vous pouvez apporter votre contribution, Folding@Home ayant annoncé participer à la lutte contre le coronavirus (Covid-19) ! L'annonce officielle est ici (en anglais) : https://foldingathome.org/2020/02/27/foldinghome-takes-up-the-fight-against-covid-19-2019-ncov/

Pour résumer, les simulations engagées ont deux objectifs :

• étudier comment le virus infecte les cellules cibles afin de comprendre l'épidémie et diminuer sa propagation
• déterminer des sites propices aux liens avec des anticorps afin d'optimiser le développement et l'efficacité du vaccin

Le premier post étant un peu obsolète, voici un condensé de la procédure pour participer à l'aventure, avec des liens mis à jour.

Tout d'abord, rendez vous sur https://foldingathome.org/start-folding/ pour télécharger le client. Si le site est un peu surchargé suite à l'engouement actuel et que vous ne voyez pas apparaitre de lien, vous pouvez télécharger manuellement le client qui correspond à votre système en passant par ce lien : https://download.foldingathome.org/releases/public/release/ (pour Windows ou OSX, prenez directement le "fah-installer", pour Linux vous aurez besoin des package séparés "fahclient" et "fahcontrol").

Une fois en possession du client, installez le et configurez votre identité comme ceci :

• Username : choisissez en un de la forme [Inpact]_Username pour être automatiquement intégré à la mini-team [Inpact] !
• Team Number : 51
• Passkey : la passkey est facultative, mais son utilisation permet de bénéficier du bonus de points sur la rapidité de retour des résultats. Vous pouvez en générer une ici : https://apps.foldingathome.org/getpasskey

Si vous avez déjà participé par le passé, il est possible de reprendre où vous en étiez en utilisant le même Username. De même pour la passkey, utiliser la même combinaison Username/Email vous permettra de retrouver la votre.

Pour toute question, besoin de support, conseils d'optimisation, ... n'hésitez pas à participer à ce sujet ou à venir faire un coucou à l'Alliance Francophone : https://forum.alliancefrancophone.org/

[toTOW]

Si le propriétaire du compte passe par ici et se reconnait, il y a une petite erreur de frappe :

Citer

[Ipact]Patch, nouveau plieur depuis le 06/03 et non-associé (mot-clé incorrect) est désormais rattaché à la miniteam INpact.
Modification effective à partir de demain.

 

[toTOW]

C'est parti, les projets arrivent en bêta. Si tout va bien, ils seront distribués à tous dès demain !

 

Citer

 

Merci à tous pour votre patience pendant que nous avons passé une semaine à décider comment utiliser au mieux la puissance supplémentaire exceptionnelle que nous avons obtenue de vous tous qui souhaitez aider dans la lutte contre le coronavirus. Nous nous somme concentrés sur 6 projets actuellement et il y a beaucoup de nouvelles données biochimiques à venir avec lesquelles nous allons probablement préparer de nouveaux projets.

 

Voici de courtes descriptions des projet. Merci de nous laisser quelques jours de plus afin de vous concocter un post complet sur le blog décrivant ce que nous espérons atteindre avec ces projets. En général, nous recherchons des conformations alternatives et des poches cachées dans les cibles de médicaments les plus prometteurs, ce qui ne peut se voir qu’en simulation et non dans les modèles statiques (note aux spécialistes, le texte original : static crystal / cryo-EM structures). Il y des données très récentes issues des dépistages maintenant disponible pour certaines d’entre elles (note : les cibles de médicaments) que nous utiliserons pour valider les simulations et aider au dépistage direct. La collecte d’un maximum de données aussi rapidement que possible sera crucial, merci encore à vous tous de rendre ceci possible !

 

Tous les projets utilisent le nouveau core GPU OpenMM 22.

• 11741: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec le récepteur humain ACE2. atomes: 165550, crédit: 15396
• 11742: protéase du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec un inhibiteur. atomes: 62227, crédit: 9405
• 11743: protéase du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) - cible médicamenteuse potentielle. atomes: 62180, crédit: 9405
• 11744: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV (virus provoquant le SRAS) piégé par un anticorps SARS-CoV S230. atomes: 109578, crédit: 7608
• 11745: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV (virus provoquant le SRAS) muté en SARS-CoV-2 (virus provoquant COVID-19) piégé par un anticorps SARS-CoV S230. atomes: 110370, crédit: 7685
• 11746: domaine de liaison au récepteur du coronavirus SARS-CoV-2 (causant le virus COVID-19) en complexe avec le récepteur humain ACE2 (structure alternative à 11741). atomes: 182699, crédit: 16615

Si vous voyez des erreurs de traduction ou que vous avez de meilleures formulations à proposer, n'hésitez pas ! 🙂

Modifié le 9 mars 2020 par toTOW

[mimoza]

Bonjour,

Je voulais participer à l'effort mais il semble que la version Linux (Debian) soit un poil obsolète.

# gdebi fahcontrol_7.5.1-1_all.deb
Reading package lists... Done
Building dependency tree        
Reading state information... Done
Reading state information... Done
Ce paquet ne peut pas être installé
Dependency is not satisfiable: python-gnome2

Et quand je recherche cette dépendance elle est uniquement présente sur une veille version de Debian (jessie & stretch) :

Une alternative/solution à ce problème ?

Le client lui semble opérationnel.

 

[Patatt]

Même chose sur Ubuntu 19.10, python2 n'est plus supporté donc le client FAH ne s'installe pas.

[CryoGen]

Bon je vais m'y (re)mettre aussi. Même si niveau grid computing j'étais sur Boinc. Je vais juste voir pour Folding@home pour l'instant 🙂

Je me met dans la mini-team Inpact \o/

 

@toTOW pour l'instant je n'ai pas le covid dans la liste des maladies, normal ?

 

Modifié le 10 mars 2020 par CryoGen

[linkin623]

Il y a 7 heures, CryoGen a écrit :

@toTOW pour l'instant je n'ai pas le covid dans la liste des maladies, normal ?

Bonsoir,

Tout pareil, je reste sur "all diseases" pour l'instant.

[toTOW]

Ca y'est, les projets sont distribués à tous !

Petit rappel pour être sûr d'en avoir : c'est du GPU et vous devez choisir la Cause "Any".

Le serveur qui distribue ces projets en chie face à la demande ...

Pour les linuxiens, un workaround pour faire marcher FAHControl (seul FAHClient est indispensable) : installer Python2 manuellement et faire cette bidouille https://foldingforum.org/viewtopic.php?p=310609#p310609

Sinon, on peut toujours régler le client avec le fichier de config et Webcontrol ... ou contrôler le client avec une machine distante.

Modifié le 10 mars 2020 par toTOW

[CryoGen]

Ah oui ca y est \o/